近日，中國科學院亞熱帶農業(yè)生態(tài)研究所畜禽健康養(yǎng)殖與農牧復合生態(tài)研究中心譚支良研究員領銜的農牧復合草食家畜健康高效養(yǎng)殖與生態(tài)服務研究團隊在微生物學權威期刊Microbiome(一區(qū)TOP，IF=13.8)發(fā)表了題為Reductive acetogenesis is a dominant process in the ruminant hindgut的研究文章。該研究以山羊為研究對象，應用轉錄組、擴增子和宏基因組測序技術，結合體外驗證試驗，揭示了反芻動物后腸道盲腸低甲烷排放性狀的形成機制。
反芻動物是畜牧業(yè)的支柱產業(yè)，也是最早被馴化用于生產的動物。它們擁有一套獨特的消化系統(tǒng)，通過依賴消化道內的微生物降解植物性飼料產生揮發(fā)性脂肪酸，從而為動物提供基本的能量來源，同時也是農業(yè)活動最大的甲烷排放源。反芻動物消化道由多個胃室（如瘤胃）和后腸（如盲腸）組成。盡管瘤胃和盲腸都是以厭氧發(fā)酵為主，超過90%的甲烷是在瘤胃中產生。盲腸具有低甲烷排放的典型特征，但其微生物組成和代謝功能尚不明晰。
本研究系統(tǒng)性地比較了瘤胃和盲腸微生物的組成、代謝功能和活性（圖1）。瘤胃富集了以Prevoltella，Ruminococcus和Butyrivbrio為代表的微生物，提高了纖維降解和丙酸生成能力，促進了甲烷菌增殖和甲烷生成。同時瘤胃中溶解氫濃度較低，這可能由于氫營養(yǎng)型產甲烷菌、富馬酸鹽還原菌（Succiniciasticum）、硝酸鹽還原菌（Desulfovibrio）對氫氣消耗的增強。盲腸富集了以Akkermansia，Alistipes和Faecousia為代表的粘蛋白降解菌，增強了微生物對宿主來源糖類的利用能力，并促進了乙酸生成。此外，盲腸中還富集了發(fā)酵產氫細菌和以HGM1287為代表的甲酸依賴型同型產乙酸菌新譜系。比較基因組發(fā)現盲腸中富集到的同型產乙酸菌在系統(tǒng)發(fā)育和功能上與瘤胃中的菌群存在顯著差異。通過對不同反芻動物物種的瘤胃和盲腸比較，進一步證實了同型產乙酸是反芻動物后腸道微生物的重要代謝過程。因此，同型產乙酸成為盲腸低甲烷排放和氫能高效利用的關鍵微生物種群。
此研究得到了國家自然科學基金、國家重點研發(fā)計劃等項目的支持，亞熱帶生態(tài)所博士生李秋爽和2021級碩士霍家斌為本論文共同第一作者，王敏研究員為通訊作者。
反芻動物瘤胃和盲腸微生物的碳水化合物和氫代謝途徑示意圖
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